Verksamheten på anläggningen består i huvudsak av forsknings- och utvecklingsarbete kring vattenreningsteknik. Det sker inom ramen för olika projekt. Utöver denna projektverksamhet ska Sjöstadsverket även användas i utbildningssyfte, som plattform för kunskapsutbyte och som visnings- och demonstrationsanläggning.Det finns ett flertal utvecklingsprojekt av såväl nationellt som internationellt intresse. Det gäller bland annat optimering av befintliga processer/tekniker, men även forskning och utveckling av nya innovativa vattenreningstekniker och processer på olika plan. Det kan handla om systemnivå, processdelsteg eller utvärdering av olika produkter.
Exempel på verksamhetsområden är:
- Grundläggande forskning och utveckling
- Tillämpad forskning och utveckling
- Referens- och demonstrationsanläggning
- Utbildning och plattform för kunskapsutbyte